Las divisiones menores del Junior tuvieron un 2016 muy bueno. El Barranquilla FC, que hace parte de la casa rojiblanca, arrasó en los torneos de la Liga de fútbol del Atlántico.
La filial juniorista compitió en seis categoría y en cinco obtuvo el título. En la otra disputó la semifinal.
Barranquilla FC logró el título en las categorías 97, 2001, 2002, 2003 y 2004. Además, lideró los campeonatos a su antojo, solo perdió un encuentro en el año y fue en la categoría 2004.
Junior, ya de rojiblanco, no se quedó atrás y también festejó a lo grande. Los tiburoncitos compitieron en dos categorías, obtuvieron un título y un subtítulo. Triunfaron en la categoría 2005, donde solo perdieron un partido a lo largo de la temporada. El subcampeonato lo consiguieron en la categoría 99. Perdieron la final en penales.
Además, el equipo sub-19 de Junior llegó a la semifinal nacional y en la sub-17 fue finalista, título que perdió ante el Deportivo Cali.
'Octavio Rivera le había dado una buena organización, pero la clave del éxito de las divisiones menores viene desde que están Álex De Alba y Álex Acosta, quienes hicieron buenas alianzas con escuelas de fútbol. Hoy podemos decir que tenemos unas divisiones menores fuertes y con plan para mejorar', expresó Arturo Reyes, director fútbol de las categorías formativas de Junior.