La Conmebol dio a conocer la conformación de los ochos grupos que hacen parte de esta primera ronda de la competencia internacional, en la que Junior clasificó de forma directa por ser uno de lo campeones de Colombia en 2023.
El equipo rojiblanco, dirigido por Arturo Reyes, quedó ubicado en el Grupo D, junto a la Liga Deportiva Universitaria de Quito, Universitario del Perú y Botafogo del Brasil.
Junior abre la Libertadores en condición de visitante enfrentando a Botafogo en el estadio Nilton Santos de Río de Janeiro. Luego tendrá dos partidos consecutivos de local ante Universitario y LDU Quito. En la cuarta jornada visitará a Universitario, luego viajará a Ecuador para la revancha con LDU Quito y cerrará su participación en la fase de grupos recibiendo en ‘el Metro’ a Botafogo.