Carlos Bacca no juega con la camiseta de Junior desde el 21 de diciembre de 2011, cuando el equipo se coronó campeón de la Liga del segundo semestre al superar al Once Caldas, en Manizales, en definición por tiros desde el punto penal (4-2).
Ese día anotó el gol de los rojiblancos durante los 90 minutos, que culminaron 2-1 a favor de los anfitriones. No alcanzó a ejecutar en la tanda desde los doce pasos.
Su poder goleador también resultó crucial en el partido de ida, cuando conquistó dos anotaciones en el triunfo 3-2. Fue su último juego en Barranquilla antes de partir a Europa.